Yonny Cardenas
Centre de Calcul IN2P3
USR 6402 CNRS
Mots clefs
Grille, Régionale, Rhône-Alpes, accès, glite, IRODS.
Résumé
Grille Rhône-Alpes est une structure qui mutualise les ressources et services informatiques de plusieurs unités situées sur la région Rhône-Alpes. Elle est une initiative de l’Institut des Grilles consistant à développer plusieurs grilles régionales sur lesquelles s’appuierait la grille nationale française (NGI).
Basée sur l’intergiciel glite et IRODS, la grille rhônalpine met potentiellement à disposition des chercheurs plus de 7000 cœurs (cpu) et plus de 50 Téraoctets de stockage en ligne. Elle est actuellement constituée des nœuds suivants: le LAPP (Annecy), le LPSC (Grenoble), l’IPNL (Lyon), l’IBCP (Lyon) et le CC-IN2P3 (Lyon). A terme, tous les organismes de recherche de la région Rhône-Alpes qui ont des infrastructures ou services informatiques à partager sont susceptibles de participer.
L’objectif de cette initiative est de faciliter l'accès à la grille aux chercheurs de différentes communautés scientifiques.
La grille Rhône-Alpes a des applications pilotes en production. Une ces applications est HOVERGEN[1] du laboratoire LBBE (UMR CNRS 5558). HOVERGEN maintient de nombreuses bases de données dédiées à la phylogénie et à l’évolution moléculaire. Elle repose sur la comparaison entre elles de centaines de milliers de séquences biologiques. Cet application a demandé plus de 6700 millions heures SI2K de calcul distribué et la gestion de 250000 fichiers gérés avec le système IRODS.
[1] http://pbil.univ-lyon1.fr/databases/hovergen.html
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Yonny Cardenas
Centre de Calcul IN2P3
USR 6402 CNRS
Mots clefs
Grille, Régionale, Rhône-Alpes, accès, glite, IRODS.
Résumé
Grille Rhône-Alpes est une structure qui mutualise les ressources et services informatiques de plusieurs unités situées sur la région Rhône-Alpes. Elle est une initiative de l’Institut des Grilles consistant à développer plusieurs grilles régionales sur lesquelles s’appuierait la grille nationale française (NGI).
Basée sur l’intergiciel glite et IRODS, la grille rhônalpine met potentiellement à disposition des chercheurs plus de 7000 cœurs (cpu) et plus de 50 Téraoctets de stockage en ligne. Elle est actuellement constituée des nœuds suivants: le LAPP (Annecy), le LPSC (Grenoble), l’IPNL (Lyon), l’IBCP (Lyon) et le CC-IN2P3 (Lyon). A terme, tous les organismes de recherche de la région Rhône-Alpes qui ont des infrastructures ou services informatiques à partager sont susceptibles de participer.
L’objectif de cette initiative est de faciliter l'accès à la grille aux chercheurs de différentes communautés scientifiques.
La grille Rhône-Alpes a des applications pilotes en production. Une ces applications est HOVERGEN[1] du laboratoire LBBE (UMR CNRS 5558). HOVERGEN maintient de nombreuses bases de données dédiées à la phylogénie et à l’évolution moléculaire. Elle repose sur la comparaison entre elles de centaines de milliers de séquences biologiques. Cet application a demandé plus de 6700 millions heures SI2K de calcul distribué et la gestion de 250000 fichiers gérés avec le système IRODS.
[1] http://pbil.univ-lyon1.fr/databases/hovergen.html
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